Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3FO00303 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF3FO00303 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms