Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QKU1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QKU1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QKU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QKU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QKU1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms