Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
I3L4J1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
I3L4J1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
I3L4J1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
I3L4J1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
I3L4J1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
I3L4J1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
I3L4J1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms