Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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