Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms