Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4E1Z4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
B4E1Z4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4E1Z4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4E1Z4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4E1Z4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4E1Z4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4E1Z4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4E1Z4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms