Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM220BPB1ANY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM220BPB1ANY3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms