Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms