Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms