Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf92A6NGG3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms