Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms