Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms