Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF22A3QJZ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms