Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE3A1L190 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms