Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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