Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms