Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUBP2Q9Y5Y2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms