Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF3AQ9Y496 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms