Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG6Q9Y2V7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG6Q9Y2V7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms