Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNEQ9Y223 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms