Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms