Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms