Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF608Q9ULD9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF608Q9ULD9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF608Q9ULD9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF608Q9ULD9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms