Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF3Q9ULD4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRPF3Q9ULD4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms