Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms