Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSL6Q9UKU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms