Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ADAM28Q9UKQ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ADAM28Q9UKQ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms