Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C4Q9UKN8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C4Q9UKN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms