Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms