Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3BQ9UH17 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms