Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms