Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms