Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLKQ9UBT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms