Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms