Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD2Q9NZN4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms