Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf78Q9NZ63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms