Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms