Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALKBH4Q9NXW9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH4Q9NXW9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms