Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms