Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ECHDC1Q9NTX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHDC1Q9NTX5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms