Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms