Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms