Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms