Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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