Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MCOLN1Q9GZU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms