Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
REXO4Q9GZR2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms