Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms