Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
REPIN1Q9BWE0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
REPIN1Q9BWE0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms