Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIRIP3Q9BW71 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms