Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms